Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Tmod1P49813 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Tmod1P49813 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Tmod1P49813 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmod1P49813 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Tmod1P49813 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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