Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA3P35244 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA3P35244 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA3P35244 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA3P35244 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA3P35244 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA3P35244 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA3P35244 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA3P35244 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA3P35244 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA3P35244 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA3P35244 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA3P35244 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA3P35244 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA3P35244 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA3P35244 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA3P35244 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA3P35244 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA3P35244 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA3P35244 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA3P35244 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA3P35244 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA3P35244 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA3P35244 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA3P35244 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA3P35244 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA3P35244 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA3P35244 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA3P35244 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA3P35244 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA3P35244 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA3P35244 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA3P35244 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA3P35244 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA3P35244 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA3P35244 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA3P35244 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA3P35244 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA3P35244 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA3P35244 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA3P35244 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA3P35244 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA3P35244 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA3P35244 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA3P35244 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA3P35244 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA3P35244 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA3P35244 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA3P35244 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA3P35244 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA3P35244 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPA3P35244 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPA3P35244 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPA3P35244 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPA3P35244 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPA3P35244 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA3P35244 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA3P35244 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA3P35244 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA3P35244 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA3P35244 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA3P35244 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA3P35244 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA3P35244 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA3P35244 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA3P35244 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA3P35244 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA3P35244 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA3P35244 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA3P35244 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA3P35244 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA3P35244 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA3P35244 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA3P35244 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA3P35244 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA3P35244 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA3P35244 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA3P35244 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA3P35244 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA3P35244 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA3P35244 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA3P35244 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms