Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTX2P32243 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTX2P32243 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTX2P32243 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OTX2P32243 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTX2P32243 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTX2P32243 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTX2P32243 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTX2P32243 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTX2P32243 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTX2P32243 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTX2P32243 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTX2P32243 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTX2P32243 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTX2P32243 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTX2P32243 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTX2P32243 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
OTX2P32243 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTX2P32243 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTX2P32243 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
OTX2P32243 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
OTX2P32243 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTX2P32243 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTX2P32243 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTX2P32243 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTX2P32243 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTX2P32243 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTX2P32243 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTX2P32243 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTX2P32243 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTX2P32243 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTX2P32243 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTX2P32243 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTX2P32243 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTX2P32243 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OTX2P32243 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OTX2P32243 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTX2P32243 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTX2P32243 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTX2P32243 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTX2P32243 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTX2P32243 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTX2P32243 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTX2P32243 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTX2P32243 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTX2P32243 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTX2P32243 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTX2P32243 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
OTX2P32243 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTX2P32243 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
OTX2P32243 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
OTX2P32243 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTX2P32243 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTX2P32243 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTX2P32243 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTX2P32243 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTX2P32243 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTX2P32243 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTX2P32243 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTX2P32243 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms