Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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