Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18528 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18528 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18528 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18528 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18528 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18528 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18528 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18528 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18528 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18528 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18528 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18528 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18528 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18528 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18528 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18528 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18528 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18528 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18528 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18528 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18528 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18528 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18528 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18528 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18528 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18528 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18528 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18528 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18528 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
P18528 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
P18528 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18528 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18528 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18528 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18528 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18528 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
P18528 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18528 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18528 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18528 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18528 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18528 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18528 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18528 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18528 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18528 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18528 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18528 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18528 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18528 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P18528 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P18528 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P18528 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P18528 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms