Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSMBP08118 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSMBP08118 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSMBP08118 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MSMBP08118 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MSMBP08118 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSMBP08118 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MSMBP08118 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSMBP08118 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSMBP08118 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSMBP08118 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSMBP08118 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MSMBP08118 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSMBP08118 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSMBP08118 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MSMBP08118 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMBP08118 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMBP08118 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMBP08118 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMBP08118 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMBP08118 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMBP08118 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMBP08118 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMBP08118 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMBP08118 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMBP08118 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMBP08118 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMBP08118 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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MSMBP08118 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMBP08118 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMBP08118 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMBP08118 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMBP08118 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMBP08118 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMBP08118 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMBP08118 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMBP08118 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMBP08118 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMBP08118 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMBP08118 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMBP08118 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMBP08118 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMBP08118 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMBP08118 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMBP08118 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMBP08118 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMBP08118 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMBP08118 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMBP08118 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMBP08118 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMBP08118 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMBP08118 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMBP08118 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMBP08118 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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MSMBP08118 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMBP08118 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMBP08118 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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MSMBP08118 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMBP08118 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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MSMBP08118 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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MSMBP08118 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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MSMBP08118 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMBP08118 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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MSMBP08118 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MSMBP08118 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MSMBP08118 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MSMBP08118 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MSMBP08118 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMBP08118 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMBP08118 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMBP08118 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMBP08118 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMBP08118 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMBP08118 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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