Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms