Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3542K7N6U2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3542K7N6U2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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