Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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