Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatipB9EKE5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatipB9EKE5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatipB9EKE5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatipB9EKE5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatipB9EKE5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatipB9EKE5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatipB9EKE5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatipB9EKE5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatipB9EKE5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatipB9EKE5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatipB9EKE5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatipB9EKE5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatipB9EKE5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatipB9EKE5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatipB9EKE5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CatipB9EKE5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CatipB9EKE5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CatipB9EKE5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms