Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Trav12-2A0N8N6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Trav12-2A0N8N6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Trav12-2A0N8N6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Trav12-2A0N8N6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Trav12-2A0N8N6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Trav12-2A0N8N6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Trav12-2A0N8N6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav12-2A0N8N6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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