Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MLH3Q9UHC1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms