Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt71Q9R0H5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt71Q9R0H5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms