Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Kcnip3Q9QXT8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Kcnip3Q9QXT8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Kcnip3Q9QXT8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Kcnip3Q9QXT8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Kcnip3Q9QXT8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Kcnip3Q9QXT8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kcnip3Q9QXT8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms