Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan4Q9DCK3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan4Q9DCK3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan4Q9DCK3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan4Q9DCK3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tspan4Q9DCK3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan4Q9DCK3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Tspan4Q9DCK3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan4Q9DCK3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan4Q9DCK3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan4Q9DCK3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan4Q9DCK3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan4Q9DCK3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tspan4Q9DCK3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Tspan4Q9DCK3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms