Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CsprsQ99388 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CsprsQ99388 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CsprsQ99388 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CsprsQ99388 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CsprsQ99388 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CsprsQ99388 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CsprsQ99388 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CsprsQ99388 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CsprsQ99388 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CsprsQ99388 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CsprsQ99388 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CsprsQ99388 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CsprsQ99388 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CsprsQ99388 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CsprsQ99388 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CsprsQ99388 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CsprsQ99388 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CsprsQ99388 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CsprsQ99388 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CsprsQ99388 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CsprsQ99388 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CsprsQ99388 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CsprsQ99388 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CsprsQ99388 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CsprsQ99388 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CsprsQ99388 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CsprsQ99388 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CsprsQ99388 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CsprsQ99388 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CsprsQ99388 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CsprsQ99388 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CsprsQ99388 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms