Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC63Q8NA47 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms