Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnma8aQ80VM8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms