Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1aQ61495 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms