Protein–RNA interactions for Protein: Q61221

Hif1a, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif1aQ61221 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hif1aQ61221 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms