Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL13

Gm527, Uncharacterized protein C14orf28 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm527Q4KL13 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm527Q4KL13 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm527Q4KL13 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm527Q4KL13 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm527Q4KL13 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm527Q4KL13 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm527Q4KL13 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm527Q4KL13 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm527Q4KL13 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm527Q4KL13 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm527Q4KL13 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm527Q4KL13 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm527Q4KL13 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm527Q4KL13 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm527Q4KL13 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm527Q4KL13 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm527Q4KL13 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm527Q4KL13 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm527Q4KL13 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm527Q4KL13 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm527Q4KL13 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm527Q4KL13 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm527Q4KL13 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm527Q4KL13 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm527Q4KL13 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm527Q4KL13 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm527Q4KL13 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm527Q4KL13 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm527Q4KL13 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms