Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATRQ13535 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATRQ13535 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRQ13535 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRQ13535 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRQ13535 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRQ13535 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRQ13535 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRQ13535 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRQ13535 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRQ13535 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRQ13535 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRQ13535 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRQ13535 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRQ13535 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRQ13535 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRQ13535 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRQ13535 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRQ13535 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRQ13535 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRQ13535 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRQ13535 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRQ13535 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRQ13535 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRQ13535 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRQ13535 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRQ13535 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRQ13535 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRQ13535 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRQ13535 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRQ13535 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRQ13535 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRQ13535 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATRQ13535 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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