Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms