Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDKL1Q00532 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms