Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nbr1P97432 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms