Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DAP3P51398 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DAP3P51398 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DAP3P51398 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DAP3P51398 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DAP3P51398 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DAP3P51398 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DAP3P51398 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DAP3P51398 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DAP3P51398 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DAP3P51398 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DAP3P51398 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DAP3P51398 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DAP3P51398 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DAP3P51398 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DAP3P51398 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DAP3P51398 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DAP3P51398 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DAP3P51398 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DAP3P51398 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DAP3P51398 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DAP3P51398 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DAP3P51398 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DAP3P51398 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DAP3P51398 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DAP3P51398 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DAP3P51398 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DAP3P51398 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DAP3P51398 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DAP3P51398 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DAP3P51398 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DAP3P51398 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DAP3P51398 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DAP3P51398 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms