Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa8P50706 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa8P50706 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa8P50706 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms