Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRIP1P50238 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRIP1P50238 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRIP1P50238 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRIP1P50238 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRIP1P50238 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRIP1P50238 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRIP1P50238 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRIP1P50238 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRIP1P50238 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRIP1P50238 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRIP1P50238 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRIP1P50238 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRIP1P50238 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRIP1P50238 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRIP1P50238 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRIP1P50238 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CRIP1P50238 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRIP1P50238 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRIP1P50238 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRIP1P50238 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRIP1P50238 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRIP1P50238 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRIP1P50238 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms