Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PKHD1P08F94 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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