Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21972J3QN38 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Gm21972J3QN38 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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