Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms