Protein–RNA interactions for Protein: A2RRP1

NBAS, Neuroblastoma-amplified sequence, humanhuman

Predictions only

Length 2,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBASA2RRP1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NBASA2RRP1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBASA2RRP1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBASA2RRP1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBASA2RRP1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBASA2RRP1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBASA2RRP1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBASA2RRP1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBASA2RRP1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBASA2RRP1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBASA2RRP1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBASA2RRP1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBASA2RRP1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBASA2RRP1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBASA2RRP1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NBASA2RRP1 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBASA2RRP1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBASA2RRP1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBASA2RRP1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBASA2RRP1 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBASA2RRP1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBASA2RRP1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBASA2RRP1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBASA2RRP1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NBASA2RRP1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NBASA2RRP1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms