Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrit3W8DXL4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrit3W8DXL4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrit3W8DXL4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrit3W8DXL4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrit3W8DXL4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrit3W8DXL4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrit3W8DXL4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrit3W8DXL4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrit3W8DXL4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrit3W8DXL4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrit3W8DXL4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrit3W8DXL4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrit3W8DXL4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrit3W8DXL4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrit3W8DXL4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrit3W8DXL4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrit3W8DXL4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrit3W8DXL4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrit3W8DXL4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrit3W8DXL4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrit3W8DXL4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrit3W8DXL4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrit3W8DXL4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrit3W8DXL4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrit3W8DXL4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrit3W8DXL4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrit3W8DXL4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrit3W8DXL4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrit3W8DXL4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrit3W8DXL4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrit3W8DXL4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrit3W8DXL4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrit3W8DXL4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrit3W8DXL4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Lrit3W8DXL4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Lrit3W8DXL4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Lrit3W8DXL4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Lrit3W8DXL4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrit3W8DXL4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrit3W8DXL4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrit3W8DXL4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrit3W8DXL4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrit3W8DXL4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrit3W8DXL4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrit3W8DXL4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrit3W8DXL4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrit3W8DXL4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrit3W8DXL4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrit3W8DXL4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrit3W8DXL4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrit3W8DXL4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrit3W8DXL4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrit3W8DXL4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrit3W8DXL4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrit3W8DXL4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrit3W8DXL4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrit3W8DXL4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrit3W8DXL4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrit3W8DXL4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrit3W8DXL4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrit3W8DXL4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrit3W8DXL4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrit3W8DXL4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrit3W8DXL4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrit3W8DXL4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrit3W8DXL4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrit3W8DXL4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrit3W8DXL4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrit3W8DXL4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrit3W8DXL4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrit3W8DXL4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrit3W8DXL4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrit3W8DXL4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrit3W8DXL4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrit3W8DXL4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrit3W8DXL4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrit3W8DXL4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrit3W8DXL4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrit3W8DXL4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrit3W8DXL4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrit3W8DXL4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrit3W8DXL4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrit3W8DXL4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrit3W8DXL4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrit3W8DXL4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrit3W8DXL4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrit3W8DXL4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrit3W8DXL4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrit3W8DXL4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrit3W8DXL4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrit3W8DXL4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrit3W8DXL4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrit3W8DXL4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrit3W8DXL4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrit3W8DXL4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrit3W8DXL4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrit3W8DXL4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrit3W8DXL4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrit3W8DXL4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
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