Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm5538W4VSP6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm5538W4VSP6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm5538W4VSP6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm5538W4VSP6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5538W4VSP6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5538W4VSP6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5538W4VSP6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5538W4VSP6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5538W4VSP6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5538W4VSP6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5538W4VSP6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5538W4VSP6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5538W4VSP6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5538W4VSP6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5538W4VSP6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5538W4VSP6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5538W4VSP6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5538W4VSP6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5538W4VSP6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5538W4VSP6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5538W4VSP6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5538W4VSP6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5538W4VSP6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5538W4VSP6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5538W4VSP6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5538W4VSP6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5538W4VSP6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5538W4VSP6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5538W4VSP6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5538W4VSP6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5538W4VSP6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5538W4VSP6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5538W4VSP6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Gm5538W4VSP6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm5538W4VSP6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm5538W4VSP6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm5538W4VSP6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm5538W4VSP6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm5538W4VSP6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5538W4VSP6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5538W4VSP6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5538W4VSP6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5538W4VSP6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5538W4VSP6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5538W4VSP6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5538W4VSP6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5538W4VSP6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5538W4VSP6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5538W4VSP6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5538W4VSP6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5538W4VSP6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5538W4VSP6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5538W4VSP6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5538W4VSP6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5538W4VSP6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5538W4VSP6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5538W4VSP6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5538W4VSP6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5538W4VSP6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm5538W4VSP6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5538W4VSP6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5538W4VSP6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5538W4VSP6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
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