Protein–RNA interactions for Protein: V9GXJ1

Gm28036, Predicted gene, 28036, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28036V9GXJ1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm28036V9GXJ1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm28036V9GXJ1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm28036V9GXJ1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm28036V9GXJ1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm28036V9GXJ1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm28036V9GXJ1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm28036V9GXJ1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm28036V9GXJ1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm28036V9GXJ1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm28036V9GXJ1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm28036V9GXJ1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm28036V9GXJ1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm28036V9GXJ1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm28036V9GXJ1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm28036V9GXJ1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm28036V9GXJ1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm28036V9GXJ1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm28036V9GXJ1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm28036V9GXJ1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm28036V9GXJ1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm28036V9GXJ1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm28036V9GXJ1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm28036V9GXJ1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm28036V9GXJ1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm28036V9GXJ1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm28036V9GXJ1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm28036V9GXJ1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm28036V9GXJ1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm28036V9GXJ1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm28036V9GXJ1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm28036V9GXJ1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm28036V9GXJ1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm28036V9GXJ1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm28036V9GXJ1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm28036V9GXJ1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm28036V9GXJ1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm28036V9GXJ1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm28036V9GXJ1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm28036V9GXJ1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm28036V9GXJ1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm28036V9GXJ1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm28036V9GXJ1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm28036V9GXJ1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm28036V9GXJ1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm28036V9GXJ1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm28036V9GXJ1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm28036V9GXJ1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm28036V9GXJ1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm28036V9GXJ1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm28036V9GXJ1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm28036V9GXJ1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm28036V9GXJ1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm28036V9GXJ1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm28036V9GXJ1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm28036V9GXJ1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm28036V9GXJ1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm28036V9GXJ1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm28036V9GXJ1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm28036V9GXJ1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm28036V9GXJ1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm28036V9GXJ1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm28036V9GXJ1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm28036V9GXJ1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm28036V9GXJ1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm28036V9GXJ1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm28036V9GXJ1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm28036V9GXJ1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm28036V9GXJ1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm28036V9GXJ1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm28036V9GXJ1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm28036V9GXJ1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm28036V9GXJ1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm28036V9GXJ1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm28036V9GXJ1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm28036V9GXJ1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm28036V9GXJ1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm28036V9GXJ1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm28036V9GXJ1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm28036V9GXJ1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm28036V9GXJ1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm28036V9GXJ1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm28036V9GXJ1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm28036V9GXJ1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm28036V9GXJ1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm28036V9GXJ1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm28036V9GXJ1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm28036V9GXJ1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms