Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2H7

Gipc2, PDZ domain-containing protein GIPC2, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc2Q9Z2H7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gipc2Q9Z2H7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gipc2Q9Z2H7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gipc2Q9Z2H7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gipc2Q9Z2H7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gipc2Q9Z2H7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gipc2Q9Z2H7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gipc2Q9Z2H7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gipc2Q9Z2H7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gipc2Q9Z2H7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gipc2Q9Z2H7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gipc2Q9Z2H7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gipc2Q9Z2H7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gipc2Q9Z2H7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gipc2Q9Z2H7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gipc2Q9Z2H7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gipc2Q9Z2H7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gipc2Q9Z2H7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gipc2Q9Z2H7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gipc2Q9Z2H7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gipc2Q9Z2H7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gipc2Q9Z2H7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gipc2Q9Z2H7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gipc2Q9Z2H7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gipc2Q9Z2H7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gipc2Q9Z2H7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gipc2Q9Z2H7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gipc2Q9Z2H7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gipc2Q9Z2H7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gipc2Q9Z2H7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gipc2Q9Z2H7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gipc2Q9Z2H7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gipc2Q9Z2H7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gipc2Q9Z2H7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gipc2Q9Z2H7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gipc2Q9Z2H7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gipc2Q9Z2H7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gipc2Q9Z2H7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gipc2Q9Z2H7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gipc2Q9Z2H7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gipc2Q9Z2H7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gipc2Q9Z2H7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gipc2Q9Z2H7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gipc2Q9Z2H7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gipc2Q9Z2H7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gipc2Q9Z2H7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gipc2Q9Z2H7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gipc2Q9Z2H7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gipc2Q9Z2H7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gipc2Q9Z2H7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gipc2Q9Z2H7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gipc2Q9Z2H7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gipc2Q9Z2H7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gipc2Q9Z2H7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gipc2Q9Z2H7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gipc2Q9Z2H7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gipc2Q9Z2H7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gipc2Q9Z2H7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gipc2Q9Z2H7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gipc2Q9Z2H7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gipc2Q9Z2H7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gipc2Q9Z2H7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gipc2Q9Z2H7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gipc2Q9Z2H7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gipc2Q9Z2H7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gipc2Q9Z2H7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gipc2Q9Z2H7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gipc2Q9Z2H7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gipc2Q9Z2H7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gipc2Q9Z2H7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gipc2Q9Z2H7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gipc2Q9Z2H7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gipc2Q9Z2H7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gipc2Q9Z2H7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gipc2Q9Z2H7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gipc2Q9Z2H7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gipc2Q9Z2H7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gipc2Q9Z2H7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gipc2Q9Z2H7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gipc2Q9Z2H7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gipc2Q9Z2H7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gipc2Q9Z2H7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gipc2Q9Z2H7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gipc2Q9Z2H7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gipc2Q9Z2H7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gipc2Q9Z2H7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gipc2Q9Z2H7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gipc2Q9Z2H7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gipc2Q9Z2H7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gipc2Q9Z2H7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gipc2Q9Z2H7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gipc2Q9Z2H7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gipc2Q9Z2H7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gipc2Q9Z2H7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gipc2Q9Z2H7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gipc2Q9Z2H7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gipc2Q9Z2H7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gipc2Q9Z2H7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gipc2Q9Z2H7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gipc2Q9Z2H7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms