Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2H5

Epb41l1, Band 4.1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 879 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l1Q9Z2H5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Epb41l1Q9Z2H5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Epb41l1Q9Z2H5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Epb41l1Q9Z2H5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Epb41l1Q9Z2H5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Epb41l1Q9Z2H5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Epb41l1Q9Z2H5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Epb41l1Q9Z2H5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Epb41l1Q9Z2H5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Epb41l1Q9Z2H5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Epb41l1Q9Z2H5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Epb41l1Q9Z2H5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Epb41l1Q9Z2H5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Epb41l1Q9Z2H5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Epb41l1Q9Z2H5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Epb41l1Q9Z2H5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Epb41l1Q9Z2H5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Epb41l1Q9Z2H5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Epb41l1Q9Z2H5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Epb41l1Q9Z2H5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Epb41l1Q9Z2H5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Epb41l1Q9Z2H5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Epb41l1Q9Z2H5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Epb41l1Q9Z2H5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Epb41l1Q9Z2H5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Epb41l1Q9Z2H5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Epb41l1Q9Z2H5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Epb41l1Q9Z2H5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Epb41l1Q9Z2H5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Epb41l1Q9Z2H5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Epb41l1Q9Z2H5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Epb41l1Q9Z2H5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Epb41l1Q9Z2H5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Epb41l1Q9Z2H5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Epb41l1Q9Z2H5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Epb41l1Q9Z2H5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Epb41l1Q9Z2H5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Epb41l1Q9Z2H5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Epb41l1Q9Z2H5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Epb41l1Q9Z2H5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Epb41l1Q9Z2H5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Epb41l1Q9Z2H5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Epb41l1Q9Z2H5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Epb41l1Q9Z2H5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Epb41l1Q9Z2H5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Epb41l1Q9Z2H5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Epb41l1Q9Z2H5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Epb41l1Q9Z2H5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Epb41l1Q9Z2H5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Epb41l1Q9Z2H5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Epb41l1Q9Z2H5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Epb41l1Q9Z2H5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Epb41l1Q9Z2H5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Epb41l1Q9Z2H5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Epb41l1Q9Z2H5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Epb41l1Q9Z2H5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Epb41l1Q9Z2H5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Epb41l1Q9Z2H5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Epb41l1Q9Z2H5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Epb41l1Q9Z2H5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Epb41l1Q9Z2H5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Epb41l1Q9Z2H5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Epb41l1Q9Z2H5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Epb41l1Q9Z2H5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Epb41l1Q9Z2H5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Epb41l1Q9Z2H5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Epb41l1Q9Z2H5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Epb41l1Q9Z2H5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Epb41l1Q9Z2H5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Epb41l1Q9Z2H5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Epb41l1Q9Z2H5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Epb41l1Q9Z2H5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Epb41l1Q9Z2H5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Epb41l1Q9Z2H5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Epb41l1Q9Z2H5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Epb41l1Q9Z2H5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Epb41l1Q9Z2H5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Epb41l1Q9Z2H5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Epb41l1Q9Z2H5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Epb41l1Q9Z2H5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Epb41l1Q9Z2H5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Epb41l1Q9Z2H5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Epb41l1Q9Z2H5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Epb41l1Q9Z2H5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Epb41l1Q9Z2H5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Epb41l1Q9Z2H5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Epb41l1Q9Z2H5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Epb41l1Q9Z2H5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Epb41l1Q9Z2H5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Epb41l1Q9Z2H5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Epb41l1Q9Z2H5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Epb41l1Q9Z2H5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Epb41l1Q9Z2H5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Epb41l1Q9Z2H5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Epb41l1Q9Z2H5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Epb41l1Q9Z2H5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Epb41l1Q9Z2H5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Epb41l1Q9Z2H5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Epb41l1Q9Z2H5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Epb41l1Q9Z2H5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms