Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdpk1Q9Z2A0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdpk1Q9Z2A0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdpk1Q9Z2A0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdpk1Q9Z2A0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.1 ms