Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn8Q9Z260 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn8Q9Z260 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn8Q9Z260 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn8Q9Z260 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn8Q9Z260 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn8Q9Z260 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn8Q9Z260 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn8Q9Z260 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn8Q9Z260 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn8Q9Z260 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn8Q9Z260 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn8Q9Z260 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Cldn8Q9Z260 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn8Q9Z260 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn8Q9Z260 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn8Q9Z260 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn8Q9Z260 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn8Q9Z260 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn8Q9Z260 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn8Q9Z260 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn8Q9Z260 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn8Q9Z260 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn8Q9Z260 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn8Q9Z260 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn8Q9Z260 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn8Q9Z260 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn8Q9Z260 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn8Q9Z260 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn8Q9Z260 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn8Q9Z260 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn8Q9Z260 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn8Q9Z260 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn8Q9Z260 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn8Q9Z260 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn8Q9Z260 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn8Q9Z260 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn8Q9Z260 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn8Q9Z260 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn8Q9Z260 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn8Q9Z260 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn8Q9Z260 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn8Q9Z260 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn8Q9Z260 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn8Q9Z260 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn8Q9Z260 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn8Q9Z260 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cldn8Q9Z260 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn8Q9Z260 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn8Q9Z260 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn8Q9Z260 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn8Q9Z260 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn8Q9Z260 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn8Q9Z260 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn8Q9Z260 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn8Q9Z260 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn8Q9Z260 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn8Q9Z260 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn8Q9Z260 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms