Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna2d3Q9Z1L5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna2d3Q9Z1L5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna2d3Q9Z1L5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna2d3Q9Z1L5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna2d3Q9Z1L5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna2d3Q9Z1L5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna2d3Q9Z1L5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna2d3Q9Z1L5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacna2d3Q9Z1L5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna2d3Q9Z1L5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms