Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG9

Msl3, Male-specific lethal 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl3Q9WVG9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Msl3Q9WVG9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Msl3Q9WVG9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Msl3Q9WVG9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Msl3Q9WVG9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Msl3Q9WVG9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Msl3Q9WVG9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Msl3Q9WVG9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Msl3Q9WVG9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Msl3Q9WVG9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Msl3Q9WVG9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Msl3Q9WVG9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Msl3Q9WVG9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Msl3Q9WVG9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Msl3Q9WVG9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Msl3Q9WVG9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Msl3Q9WVG9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Msl3Q9WVG9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Msl3Q9WVG9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Msl3Q9WVG9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Msl3Q9WVG9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Msl3Q9WVG9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Msl3Q9WVG9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Msl3Q9WVG9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Msl3Q9WVG9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Msl3Q9WVG9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Msl3Q9WVG9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Msl3Q9WVG9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Msl3Q9WVG9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Msl3Q9WVG9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Msl3Q9WVG9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Msl3Q9WVG9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Msl3Q9WVG9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Msl3Q9WVG9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Msl3Q9WVG9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Msl3Q9WVG9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Msl3Q9WVG9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Msl3Q9WVG9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Msl3Q9WVG9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Msl3Q9WVG9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Msl3Q9WVG9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Msl3Q9WVG9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Msl3Q9WVG9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Msl3Q9WVG9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Msl3Q9WVG9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Msl3Q9WVG9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Msl3Q9WVG9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Msl3Q9WVG9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Msl3Q9WVG9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Msl3Q9WVG9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Msl3Q9WVG9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Msl3Q9WVG9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Msl3Q9WVG9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Msl3Q9WVG9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Msl3Q9WVG9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Msl3Q9WVG9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Msl3Q9WVG9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Msl3Q9WVG9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Msl3Q9WVG9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Msl3Q9WVG9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Msl3Q9WVG9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Msl3Q9WVG9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Msl3Q9WVG9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Msl3Q9WVG9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Msl3Q9WVG9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Msl3Q9WVG9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Msl3Q9WVG9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Msl3Q9WVG9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Msl3Q9WVG9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Msl3Q9WVG9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Msl3Q9WVG9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Msl3Q9WVG9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Msl3Q9WVG9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Msl3Q9WVG9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Msl3Q9WVG9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Msl3Q9WVG9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Msl3Q9WVG9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Msl3Q9WVG9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Msl3Q9WVG9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Msl3Q9WVG9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Msl3Q9WVG9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Msl3Q9WVG9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Msl3Q9WVG9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Msl3Q9WVG9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Msl3Q9WVG9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Msl3Q9WVG9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Msl3Q9WVG9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Msl3Q9WVG9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Msl3Q9WVG9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Msl3Q9WVG9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Msl3Q9WVG9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Msl3Q9WVG9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Msl3Q9WVG9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Msl3Q9WVG9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Msl3Q9WVG9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Msl3Q9WVG9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Msl3Q9WVG9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msl3Q9WVG9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msl3Q9WVG9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msl3Q9WVG9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms