Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF8

Tusc2, Tumor suppressor candidate 2, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tusc2Q9WVF8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tusc2Q9WVF8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tusc2Q9WVF8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tusc2Q9WVF8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tusc2Q9WVF8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tusc2Q9WVF8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tusc2Q9WVF8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tusc2Q9WVF8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tusc2Q9WVF8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tusc2Q9WVF8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tusc2Q9WVF8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tusc2Q9WVF8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tusc2Q9WVF8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tusc2Q9WVF8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tusc2Q9WVF8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tusc2Q9WVF8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tusc2Q9WVF8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tusc2Q9WVF8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tusc2Q9WVF8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tusc2Q9WVF8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tusc2Q9WVF8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tusc2Q9WVF8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tusc2Q9WVF8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tusc2Q9WVF8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tusc2Q9WVF8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tusc2Q9WVF8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tusc2Q9WVF8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tusc2Q9WVF8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tusc2Q9WVF8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tusc2Q9WVF8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tusc2Q9WVF8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tusc2Q9WVF8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tusc2Q9WVF8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tusc2Q9WVF8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tusc2Q9WVF8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tusc2Q9WVF8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tusc2Q9WVF8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tusc2Q9WVF8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tusc2Q9WVF8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tusc2Q9WVF8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tusc2Q9WVF8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tusc2Q9WVF8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tusc2Q9WVF8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tusc2Q9WVF8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tusc2Q9WVF8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tusc2Q9WVF8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tusc2Q9WVF8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tusc2Q9WVF8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tusc2Q9WVF8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tusc2Q9WVF8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tusc2Q9WVF8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tusc2Q9WVF8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tusc2Q9WVF8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tusc2Q9WVF8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tusc2Q9WVF8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tusc2Q9WVF8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tusc2Q9WVF8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tusc2Q9WVF8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tusc2Q9WVF8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tusc2Q9WVF8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tusc2Q9WVF8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tusc2Q9WVF8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tusc2Q9WVF8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tusc2Q9WVF8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tusc2Q9WVF8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tusc2Q9WVF8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tusc2Q9WVF8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tusc2Q9WVF8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tusc2Q9WVF8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tusc2Q9WVF8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tusc2Q9WVF8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tusc2Q9WVF8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tusc2Q9WVF8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tusc2Q9WVF8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tusc2Q9WVF8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tusc2Q9WVF8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tusc2Q9WVF8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tusc2Q9WVF8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tusc2Q9WVF8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tusc2Q9WVF8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tusc2Q9WVF8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tusc2Q9WVF8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tusc2Q9WVF8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tusc2Q9WVF8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tusc2Q9WVF8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tusc2Q9WVF8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tusc2Q9WVF8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tusc2Q9WVF8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tusc2Q9WVF8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tusc2Q9WVF8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tusc2Q9WVF8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tusc2Q9WVF8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tusc2Q9WVF8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tusc2Q9WVF8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tusc2Q9WVF8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tusc2Q9WVF8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tusc2Q9WVF8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tusc2Q9WVF8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tusc2Q9WVF8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tusc2Q9WVF8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms