Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ArcQ9WV31 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ArcQ9WV31 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ArcQ9WV31 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ArcQ9WV31 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ArcQ9WV31 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ArcQ9WV31 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ArcQ9WV31 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ArcQ9WV31 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ArcQ9WV31 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ArcQ9WV31 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ArcQ9WV31 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ArcQ9WV31 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ArcQ9WV31 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ArcQ9WV31 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ArcQ9WV31 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ArcQ9WV31 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ArcQ9WV31 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ArcQ9WV31 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ArcQ9WV31 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ArcQ9WV31 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ArcQ9WV31 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ArcQ9WV31 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ArcQ9WV31 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ArcQ9WV31 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ArcQ9WV31 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ArcQ9WV31 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ArcQ9WV31 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ArcQ9WV31 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ArcQ9WV31 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ArcQ9WV31 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ArcQ9WV31 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ArcQ9WV31 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ArcQ9WV31 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ArcQ9WV31 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ArcQ9WV31 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ArcQ9WV31 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ArcQ9WV31 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ArcQ9WV31 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ArcQ9WV31 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ArcQ9WV31 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ArcQ9WV31 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ArcQ9WV31 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ArcQ9WV31 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ArcQ9WV31 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ArcQ9WV31 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ArcQ9WV31 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ArcQ9WV31 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ArcQ9WV31 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ArcQ9WV31 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ArcQ9WV31 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ArcQ9WV31 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ArcQ9WV31 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ArcQ9WV31 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ArcQ9WV31 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ArcQ9WV31 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ArcQ9WV31 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ArcQ9WV31 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ArcQ9WV31 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ArcQ9WV31 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ArcQ9WV31 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ArcQ9WV31 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ArcQ9WV31 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ArcQ9WV31 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ArcQ9WV31 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ArcQ9WV31 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ArcQ9WV31 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ArcQ9WV31 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ArcQ9WV31 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ArcQ9WV31 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ArcQ9WV31 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ArcQ9WV31 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ArcQ9WV31 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ArcQ9WV31 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ArcQ9WV31 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ArcQ9WV31 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ArcQ9WV31 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ArcQ9WV31 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ArcQ9WV31 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ArcQ9WV31 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ArcQ9WV31 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ArcQ9WV31 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ArcQ9WV31 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ArcQ9WV31 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ArcQ9WV31 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ArcQ9WV31 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ArcQ9WV31 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ArcQ9WV31 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ArcQ9WV31 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ArcQ9WV31 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ArcQ9WV31 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ArcQ9WV31 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ArcQ9WV31 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ArcQ9WV31 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ArcQ9WV31 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ArcQ9WV31 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ArcQ9WV31 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ArcQ9WV31 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ArcQ9WV31 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ArcQ9WV31 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms