Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP7

Uchl5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L5, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl5Q9WUP7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Uchl5Q9WUP7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Uchl5Q9WUP7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Uchl5Q9WUP7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Uchl5Q9WUP7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uchl5Q9WUP7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uchl5Q9WUP7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uchl5Q9WUP7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uchl5Q9WUP7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uchl5Q9WUP7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Uchl5Q9WUP7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uchl5Q9WUP7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Uchl5Q9WUP7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Uchl5Q9WUP7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Uchl5Q9WUP7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Uchl5Q9WUP7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Uchl5Q9WUP7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Uchl5Q9WUP7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Uchl5Q9WUP7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Uchl5Q9WUP7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Uchl5Q9WUP7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Uchl5Q9WUP7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Uchl5Q9WUP7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Uchl5Q9WUP7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Uchl5Q9WUP7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Uchl5Q9WUP7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Uchl5Q9WUP7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uchl5Q9WUP7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uchl5Q9WUP7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uchl5Q9WUP7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uchl5Q9WUP7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uchl5Q9WUP7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uchl5Q9WUP7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Uchl5Q9WUP7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Uchl5Q9WUP7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Uchl5Q9WUP7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Uchl5Q9WUP7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Uchl5Q9WUP7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Uchl5Q9WUP7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Uchl5Q9WUP7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Uchl5Q9WUP7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Uchl5Q9WUP7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Uchl5Q9WUP7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Uchl5Q9WUP7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Uchl5Q9WUP7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Uchl5Q9WUP7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Uchl5Q9WUP7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Uchl5Q9WUP7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Uchl5Q9WUP7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uchl5Q9WUP7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uchl5Q9WUP7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uchl5Q9WUP7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uchl5Q9WUP7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uchl5Q9WUP7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uchl5Q9WUP7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uchl5Q9WUP7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uchl5Q9WUP7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uchl5Q9WUP7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uchl5Q9WUP7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uchl5Q9WUP7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uchl5Q9WUP7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uchl5Q9WUP7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uchl5Q9WUP7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uchl5Q9WUP7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uchl5Q9WUP7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uchl5Q9WUP7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uchl5Q9WUP7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uchl5Q9WUP7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Uchl5Q9WUP7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Uchl5Q9WUP7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Uchl5Q9WUP7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Uchl5Q9WUP7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Uchl5Q9WUP7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Uchl5Q9WUP7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uchl5Q9WUP7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uchl5Q9WUP7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uchl5Q9WUP7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uchl5Q9WUP7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uchl5Q9WUP7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Uchl5Q9WUP7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uchl5Q9WUP7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uchl5Q9WUP7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uchl5Q9WUP7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uchl5Q9WUP7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uchl5Q9WUP7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uchl5Q9WUP7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Uchl5Q9WUP7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uchl5Q9WUP7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms