Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUM4

Coro1c, Coronin-1C, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Coro1cQ9WUM4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Coro1cQ9WUM4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Coro1cQ9WUM4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Coro1cQ9WUM4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Coro1cQ9WUM4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Coro1cQ9WUM4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Coro1cQ9WUM4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Coro1cQ9WUM4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Coro1cQ9WUM4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Coro1cQ9WUM4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Coro1cQ9WUM4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Coro1cQ9WUM4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Coro1cQ9WUM4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Coro1cQ9WUM4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Coro1cQ9WUM4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Coro1cQ9WUM4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Coro1cQ9WUM4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Coro1cQ9WUM4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Coro1cQ9WUM4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Coro1cQ9WUM4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Coro1cQ9WUM4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Coro1cQ9WUM4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Coro1cQ9WUM4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Coro1cQ9WUM4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Coro1cQ9WUM4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Coro1cQ9WUM4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Coro1cQ9WUM4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Coro1cQ9WUM4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Coro1cQ9WUM4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Coro1cQ9WUM4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Coro1cQ9WUM4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Coro1cQ9WUM4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Coro1cQ9WUM4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Coro1cQ9WUM4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Coro1cQ9WUM4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Coro1cQ9WUM4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Coro1cQ9WUM4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Coro1cQ9WUM4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Coro1cQ9WUM4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Coro1cQ9WUM4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Coro1cQ9WUM4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Coro1cQ9WUM4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Coro1cQ9WUM4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Coro1cQ9WUM4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Coro1cQ9WUM4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Coro1cQ9WUM4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Coro1cQ9WUM4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Coro1cQ9WUM4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Coro1cQ9WUM4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Coro1cQ9WUM4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Coro1cQ9WUM4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Coro1cQ9WUM4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Coro1cQ9WUM4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Coro1cQ9WUM4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Coro1cQ9WUM4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Coro1cQ9WUM4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Coro1cQ9WUM4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Coro1cQ9WUM4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Coro1cQ9WUM4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Coro1cQ9WUM4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Coro1cQ9WUM4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Coro1cQ9WUM4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Coro1cQ9WUM4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Coro1cQ9WUM4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Coro1cQ9WUM4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Coro1cQ9WUM4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Coro1cQ9WUM4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Coro1cQ9WUM4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Coro1cQ9WUM4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Coro1cQ9WUM4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Coro1cQ9WUM4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Coro1cQ9WUM4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Coro1cQ9WUM4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Coro1cQ9WUM4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Coro1cQ9WUM4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Coro1cQ9WUM4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Coro1cQ9WUM4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Coro1cQ9WUM4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Coro1cQ9WUM4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Coro1cQ9WUM4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Coro1cQ9WUM4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Coro1cQ9WUM4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Coro1cQ9WUM4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Coro1cQ9WUM4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Coro1cQ9WUM4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Coro1cQ9WUM4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Coro1cQ9WUM4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Coro1cQ9WUM4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Coro1cQ9WUM4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Coro1cQ9WUM4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Coro1cQ9WUM4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Coro1cQ9WUM4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Coro1cQ9WUM4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Coro1cQ9WUM4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Coro1cQ9WUM4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Coro1cQ9WUM4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Coro1cQ9WUM4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Coro1cQ9WUM4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Coro1cQ9WUM4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Coro1cQ9WUM4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms