Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn3Q9WUK7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn3Q9WUK7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Opn3Q9WUK7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn3Q9WUK7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn3Q9WUK7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn3Q9WUK7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn3Q9WUK7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn3Q9WUK7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn3Q9WUK7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn3Q9WUK7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn3Q9WUK7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn3Q9WUK7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn3Q9WUK7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Opn3Q9WUK7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Opn3Q9WUK7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Opn3Q9WUK7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn3Q9WUK7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Opn3Q9WUK7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Opn3Q9WUK7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn3Q9WUK7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn3Q9WUK7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn3Q9WUK7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn3Q9WUK7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn3Q9WUK7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn3Q9WUK7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn3Q9WUK7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn3Q9WUK7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn3Q9WUK7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn3Q9WUK7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn3Q9WUK7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn3Q9WUK7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn3Q9WUK7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn3Q9WUK7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn3Q9WUK7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn3Q9WUK7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn3Q9WUK7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn3Q9WUK7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn3Q9WUK7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn3Q9WUK7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn3Q9WUK7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn3Q9WUK7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn3Q9WUK7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn3Q9WUK7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn3Q9WUK7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn3Q9WUK7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn3Q9WUK7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn3Q9WUK7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms