Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU84

Ccs, Copper chaperone for superoxide dismutase, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsQ9WU84 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CcsQ9WU84 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CcsQ9WU84 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CcsQ9WU84 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CcsQ9WU84 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CcsQ9WU84 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CcsQ9WU84 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CcsQ9WU84 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CcsQ9WU84 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CcsQ9WU84 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CcsQ9WU84 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CcsQ9WU84 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CcsQ9WU84 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CcsQ9WU84 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CcsQ9WU84 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CcsQ9WU84 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CcsQ9WU84 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CcsQ9WU84 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CcsQ9WU84 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CcsQ9WU84 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CcsQ9WU84 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CcsQ9WU84 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CcsQ9WU84 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CcsQ9WU84 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CcsQ9WU84 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcsQ9WU84 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcsQ9WU84 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcsQ9WU84 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcsQ9WU84 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcsQ9WU84 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcsQ9WU84 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcsQ9WU84 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CcsQ9WU84 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CcsQ9WU84 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CcsQ9WU84 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CcsQ9WU84 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CcsQ9WU84 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcsQ9WU84 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CcsQ9WU84 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcsQ9WU84 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcsQ9WU84 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcsQ9WU84 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcsQ9WU84 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcsQ9WU84 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcsQ9WU84 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcsQ9WU84 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CcsQ9WU84 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcsQ9WU84 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcsQ9WU84 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcsQ9WU84 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcsQ9WU84 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcsQ9WU84 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcsQ9WU84 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CcsQ9WU84 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CcsQ9WU84 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CcsQ9WU84 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CcsQ9WU84 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CcsQ9WU84 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CcsQ9WU84 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CcsQ9WU84 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CcsQ9WU84 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CcsQ9WU84 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CcsQ9WU84 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CcsQ9WU84 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CcsQ9WU84 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CcsQ9WU84 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CcsQ9WU84 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CcsQ9WU84 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CcsQ9WU84 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CcsQ9WU84 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CcsQ9WU84 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CcsQ9WU84 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CcsQ9WU84 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CcsQ9WU84 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CcsQ9WU84 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms