Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pdcd6ipQ9WU78 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pdcd6ipQ9WU78 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pdcd6ipQ9WU78 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pdcd6ipQ9WU78 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdcd6ipQ9WU78 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdcd6ipQ9WU78 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdcd6ipQ9WU78 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdcd6ipQ9WU78 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdcd6ipQ9WU78 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdcd6ipQ9WU78 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdcd6ipQ9WU78 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdcd6ipQ9WU78 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdcd6ipQ9WU78 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdcd6ipQ9WU78 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdcd6ipQ9WU78 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdcd6ipQ9WU78 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdcd6ipQ9WU78 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdcd6ipQ9WU78 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdcd6ipQ9WU78 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdcd6ipQ9WU78 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdcd6ipQ9WU78 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdcd6ipQ9WU78 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pdcd6ipQ9WU78 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pdcd6ipQ9WU78 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pdcd6ipQ9WU78 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pdcd6ipQ9WU78 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdcd6ipQ9WU78 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdcd6ipQ9WU78 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdcd6ipQ9WU78 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdcd6ipQ9WU78 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdcd6ipQ9WU78 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdcd6ipQ9WU78 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdcd6ipQ9WU78 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdcd6ipQ9WU78 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdcd6ipQ9WU78 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdcd6ipQ9WU78 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdcd6ipQ9WU78 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdcd6ipQ9WU78 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pdcd6ipQ9WU78 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pdcd6ipQ9WU78 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdcd6ipQ9WU78 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdcd6ipQ9WU78 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdcd6ipQ9WU78 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdcd6ipQ9WU78 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdcd6ipQ9WU78 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdcd6ipQ9WU78 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdcd6ipQ9WU78 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdcd6ipQ9WU78 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdcd6ipQ9WU78 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdcd6ipQ9WU78 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdcd6ipQ9WU78 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdcd6ipQ9WU78 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdcd6ipQ9WU78 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdcd6ipQ9WU78 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdcd6ipQ9WU78 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdcd6ipQ9WU78 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdcd6ipQ9WU78 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdcd6ipQ9WU78 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdcd6ipQ9WU78 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdcd6ipQ9WU78 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdcd6ipQ9WU78 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdcd6ipQ9WU78 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdcd6ipQ9WU78 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdcd6ipQ9WU78 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pdcd6ipQ9WU78 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pdcd6ipQ9WU78 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pdcd6ipQ9WU78 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pdcd6ipQ9WU78 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pdcd6ipQ9WU78 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pdcd6ipQ9WU78 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pdcd6ipQ9WU78 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pdcd6ipQ9WU78 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pdcd6ipQ9WU78 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pdcd6ipQ9WU78 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pdcd6ipQ9WU78 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pdcd6ipQ9WU78 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdcd6ipQ9WU78 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdcd6ipQ9WU78 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pdcd6ipQ9WU78 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pdcd6ipQ9WU78 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pdcd6ipQ9WU78 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pdcd6ipQ9WU78 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pdcd6ipQ9WU78 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcd6ipQ9WU78 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcd6ipQ9WU78 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcd6ipQ9WU78 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcd6ipQ9WU78 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcd6ipQ9WU78 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pdcd6ipQ9WU78 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pdcd6ipQ9WU78 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdcd6ipQ9WU78 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdcd6ipQ9WU78 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdcd6ipQ9WU78 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms