Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scnn1bQ9WU38 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scnn1bQ9WU38 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scnn1bQ9WU38 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scnn1bQ9WU38 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scnn1bQ9WU38 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scnn1bQ9WU38 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scnn1bQ9WU38 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scnn1bQ9WU38 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scnn1bQ9WU38 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scnn1bQ9WU38 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scnn1bQ9WU38 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scnn1bQ9WU38 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scnn1bQ9WU38 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scnn1bQ9WU38 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scnn1bQ9WU38 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scnn1bQ9WU38 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scnn1bQ9WU38 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scnn1bQ9WU38 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scnn1bQ9WU38 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scnn1bQ9WU38 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scnn1bQ9WU38 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scnn1bQ9WU38 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scnn1bQ9WU38 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scnn1bQ9WU38 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scnn1bQ9WU38 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scnn1bQ9WU38 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scnn1bQ9WU38 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scnn1bQ9WU38 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scnn1bQ9WU38 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scnn1bQ9WU38 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Scnn1bQ9WU38 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scnn1bQ9WU38 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scnn1bQ9WU38 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scnn1bQ9WU38 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scnn1bQ9WU38 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scnn1bQ9WU38 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scnn1bQ9WU38 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scnn1bQ9WU38 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scnn1bQ9WU38 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Scnn1bQ9WU38 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scnn1bQ9WU38 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scnn1bQ9WU38 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scnn1bQ9WU38 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scnn1bQ9WU38 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scnn1bQ9WU38 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scnn1bQ9WU38 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scnn1bQ9WU38 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scnn1bQ9WU38 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scnn1bQ9WU38 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scnn1bQ9WU38 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scnn1bQ9WU38 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scnn1bQ9WU38 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scnn1bQ9WU38 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scnn1bQ9WU38 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scnn1bQ9WU38 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scnn1bQ9WU38 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scnn1bQ9WU38 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scnn1bQ9WU38 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scnn1bQ9WU38 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scnn1bQ9WU38 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scnn1bQ9WU38 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scnn1bQ9WU38 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Scnn1bQ9WU38 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Scnn1bQ9WU38 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scnn1bQ9WU38 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scnn1bQ9WU38 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scnn1bQ9WU38 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scnn1bQ9WU38 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scnn1bQ9WU38 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scnn1bQ9WU38 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Scnn1bQ9WU38 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scnn1bQ9WU38 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scnn1bQ9WU38 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scnn1bQ9WU38 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scnn1bQ9WU38 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scnn1bQ9WU38 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Scnn1bQ9WU38 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Scnn1bQ9WU38 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scnn1bQ9WU38 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scnn1bQ9WU38 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scnn1bQ9WU38 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scnn1bQ9WU38 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scnn1bQ9WU38 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scnn1bQ9WU38 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scnn1bQ9WU38 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scnn1bQ9WU38 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scnn1bQ9WU38 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scnn1bQ9WU38 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scnn1bQ9WU38 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Scnn1bQ9WU38 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scnn1bQ9WU38 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scnn1bQ9WU38 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scnn1bQ9WU38 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scnn1bQ9WU38 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scnn1bQ9WU38 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scnn1bQ9WU38 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scnn1bQ9WU38 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scnn1bQ9WU38 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scnn1bQ9WU38 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms