Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trex2Q9R1A9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trex2Q9R1A9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trex2Q9R1A9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trex2Q9R1A9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trex2Q9R1A9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trex2Q9R1A9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trex2Q9R1A9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trex2Q9R1A9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trex2Q9R1A9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trex2Q9R1A9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trex2Q9R1A9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trex2Q9R1A9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trex2Q9R1A9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trex2Q9R1A9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trex2Q9R1A9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trex2Q9R1A9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trex2Q9R1A9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trex2Q9R1A9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trex2Q9R1A9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trex2Q9R1A9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trex2Q9R1A9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trex2Q9R1A9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trex2Q9R1A9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trex2Q9R1A9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trex2Q9R1A9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trex2Q9R1A9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trex2Q9R1A9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trex2Q9R1A9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trex2Q9R1A9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trex2Q9R1A9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms